Aula 1

Semabio

Carolina Musso

IB/UnB

Sobre o curso

  • Origens

  • Estrutura:

    • Aula 1: Instalação e Rmarkdown
    • Aula 2: Erros comuns e gráficos com ggplot
    • Aula 3: Tabelas resumo e testes estatísticos
    • Aula 4: Pendências e Relatório automatizado final

Nossa bibliografia

Quem somos nós?

  • Bióloga, doutora em ecologia de vegetal 🌱

  • Servidora da SES/DF - Vigilância Epidemiológica

  • Pesquisadora Colaboradora UnB

  • Estudante (eternamente) de Estatística na UnB

  • Fã de Sara’s Scribbles e outros cartoons

cmusso86@gmail.com; GitHub: cmusso86; Linkedin: cmusso86

Mas o que eu faço mesmo na prática?

  • Ajudo as pessoas com análises em R.

  • Já ouvira falar? Enquete

  • Que nada a ver…

  • Mas peraí, essa apresentação é pra ficar falando de você ou é pra ajudar a gente em alguma coisa afinal?

Calma jovem padawan …

  • Vamos chegar lá!

  • O que todo esse caminho tem em comum?

  • Análise de dados!

A revolução dos dados

“Entre o início da civilização e 2003, foram criados 5 exabytes de informação, mas atualmente essa quantidade de informação é gerada a cada 2 dias, e o ritmo está acelerando.”

  • Eric Schmidt, CEO Google

Importância da reprodutibilidade

  • Crise de repoducibilidade/replicabilidade

  • Why

O que é o R

Enquete

  • Um programa de análise Estatística?

  • Uma linguagem de programação?

  • Um ambiente de programação?

  • Uma comunidade?

  • TODAS AS ALTERNATIVAS!

O que é uma linguagem de programação?

  • Instruções que damos para a máquina resolver problemas.

  • Mais flexível e poderoso do que operar somente a interface

E o que dá pra fazer no R?

  • Testes Estatísticos

  • Gráficos

  • Tabelas

  • Mapas

  • Web Apps

  • Desenvolver pacotes…

  • Sua monografia/tese/relatórioIC INTEIRA. Do início ao fim.

E o que dá pra fazer no R?

Resumindo… Tudo!

Enquete (é difícil?)

Jornada do Herói

Exemplos

Outras vantagens

  • Gratuito e open source:
    • Vai conseguir usar sempre!
  • Um grande processo colaborativo:
    • O que você imaginar alguém já fez! (E provavelmente vai te ajudar)
  • “Conversa” com outras linguagens e ambientes.
    • LateX, Markdown, Python, Collab, GitHub…
  • REPRODUTIBIBILIDADE DAS SUAS ANÁLISES.
    • Bom pra você e para a ciência!

Cursos

Outras recomendações

Aceite o desafio!

Quem criou o R

E o R-Studio?

  • Criado pela empresa RStudio, atualmente Posit

  • Hadley Wickham: Cientista de dados chefe

  • Esforços atualmente para integrar com outras linguagem além do R

Dois softwares

  • Um é a linguagem em si o cérebro: R

  • O outro É a interface: O RStudio

    • Existem outras formas de usar o R, mas a mais intuitiva e a que vamos nos familirizar aqui é por meio do RStudio.

Instalando o R

  • Vamos seguir as istruções da mantenedora do RStudio, que é a Posit:

    • Instalar. www.posit.co

    • Canto superior direito

  • Tutorial

  • Resumindo: Baixe tanto o R quanto o RStudio e instale ambos seguindo a configuração padrão

Material para aprofundamento

Como é a cara do R (sem RStudio)

  • meio assustador não é?

Os Quatro Paineis do R-Studio

Prática

Rmarkdown

Vamos ver algo especial do R

  • Bem diferente de como foi criado nos anos 90

  • Rmarkdown

  • Quarto

  • YiHui

R de trás-pra-frente

  • Vamos ver um código pronto!

  • Faça o download do arquivo disponível na plataforma e dê uma olhada no código por um tempo!

  • Coloque as suas percepções, pontos que achou interessante, pontos que conseguiu “entender” no fórum de discussões!

Em seguida, faça como eu!

  • Se deu tudo errado, não se desespere!

Prática!

Você conseguiu diferenciar essas partes?

  • Cabeçalho

  • Texto

  • Código

Cabeçalho

  • Metadados

  • Linguagem YAML

  • É MUITO sensível (qualquer coisa atrapalha)

Texto

  • Markdown

Código

  • É o coração do R mesmo

    • Linguagem de programação

    • Como que difere de Excel (apontar e clicar?)

Brincando com o código

  • Mudar de cor, posição …

O que são esses chunks afinal?

  • O “código” própriamente dito

  • As partes dos chunks

    • cabeçalho (do chunk)
    • conteúdo
      • código
      • comentários

Desafio

  • Hashtag: Qual a diferença dele (#) na parte do texto e dentro dos chunks de código?
  • Código inline: Há outro tipo de escrita de código em R no script sem ser dentro dos chunks. Tente encontra-lo e coloque seus comentários no fórum!

Pacotes

E os pacotes o que são?

  • Extensões do R

  • Teremos uma aula só sobre o uso de pacotes

Erros comuns

Primeira coisa

  • Ler o erro! 😂

    • Nem sempre ajuda muito…mas sempre comece por aí!

    • Atenção que as vezes não é um Erro, e sim um “Warning”

Em seguida

  • Perguntar ao Google! (ou ao ChatGPT)

    • Simplesmente copie e cole o erro lá!

No Google

  • Dê preferêcia resultados do:

    • StackOverflow ; RBloggers ; RStudio / RProject

  • E no ChatGPT?

Documentação oficial

  • Buscar no CRAN o pdf da documentação oficial

  • Procurar na aba ajuda pela documentação da função que está tentando usar

  • Vamos lá!

Quiz

Até amanhã!